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国家生物信息中心相助研究鉴定青少年早发性痛风新危害基因位点

痛风是由血清尿酸升高引起的代谢性疾病 ,多爆发于成年男性 。在全球规模内患病率急剧增加且泛起明显年轻化趋势 ,并在枢纽畸形、肝肾功效受损及引发心血管疾病等方面对青少年健康造成了严重威胁 。目前针对青少年痛风(发病年龄≤19岁)遗传机制及致病机理的研究较少 ,现已成为青少年痛风防治的瓶颈 。故针对青少年痛流行列的遗传研究不但能为痛风的机制提供新的见解 ,也能为青少年痛风患者提供新的治疗靶点 。

8月8日 ,国家生物信息中心偏向东团队和青岛大学隶属医院李长贵团队相助 ,在Arthritis & Rheumatology?期刊在线宣布了题为“Novel genetic loci in early-onset gout derived from whole genome sequencing of an adolescent gout cohort”的研究论文 ,全面描述了青少年痛风患者基因组特征并确定了早发性痛风的新危害位点 ,将有助于更好地了解青少年爆发性痛风的发病机制 ,为危害预测和干预预防青少年早发性痛风提供重要依据 。

该研究对905名青少年痛风发明行列进行了全基因组测序 ,刻画了青少年痛风和高尿酸血症的基因组图谱 ,并通过全基因组关联剖析、序列内核关联测试和全转录组关联剖析 ,以及在2834例早发性痛风验证后的荟萃剖析 ,鉴定出两个新的基因座(Pmeta < 5.0×10-8):RCOR1(rs12887440与rs8009475)和FSTL5-MIR4454(rs35213808) ,提示可能与早发性痛风相关 。

RCOR1?相关的两个最显著关联SNV位于RCOR1?的启动子(rs8009475)和第二个内含子(rs12887440) 。在痛风相关细胞和组织中 ,包括rs12887440的区域富含活性组卵白修饰标记(H3K4me1和H3K27ac) ,为潜在的增强子 ,并通过远程染色质构象相互作用调理启动子 ,提示rs12887440(A为危害等位基因)可能影响RCOR1?的表达 。本研究进一步通过RT-qPCR和RNA测序 ,在32名青少年痛风患者的全血中验证了rs12887440-AA携带者中RCOR1 mRNA水平明显高于非携带者rs12887440-GG ,证明rs12887440与RCOR1?的表达有关 。而rs12887440-AA与rs12887440-GG携带者之间的差别表达基因加入免疫系统历程、免疫反应、适应性免疫反应、免疫反应调控等免疫相关通路 ,且rs12887440和rs8009475与尿酸水平无关 ,提示RCOR1?可能加入痛风爆发的炎症历程 。通过THP-1巨噬细胞敲除实验验证发明 ,袒露于尿酸盐晶体刺激免疫反应后 ,RCOR1?敲低细胞中细胞内IL-1β前体卵白水平和上清液中IL-1β卵白水平显著降低 ,标明RCOR1?可能积极加入痛风炎症的生长 ,对尿酸盐晶体炎症反应的更大敏感性可能是早期爆发痛风的主要原因 。

别的 ,研究团队正在连续构建中国痛流行列 ,增加行列数量与行列数据种类 ,并荟萃多种组学数据建立痛风多组学数据库 。充分利用痛流行列与数据库建设 ,在已有研究基础上使用痛风SNV进行痛风分型 ,或在痛风危害评分的基础上使用SNV结合临床表型 ,并进一步结合多组学提升痛风分型准确率 ,建立适用于亚洲人的危害评分模型 ,对痛风进行临床指导 ,提升危害预测能力 。该研究体系不但增进了医学研究与临床实践的深度融合 ,还对提升慢性庞大疾病的防治水平、改善患者生活质量具有重要意义 。

青岛大学隶属医院季爱昌博士、国家生物信息中心隋阳博士、青岛大学隶属医院薛晓梅、纪晓朋、国家生物信息中心时文睿博士、上海交通大学BIO-X研究院师咏勇研究员为本文的配合第一作者 ,青岛大学隶属医院李长贵主任医师、国家生物信息中心偏向东研究员、渠鸿竹副研究员、以及美国阿拉巴马大学Tony R. Merriman教授为本文配合通讯作者 。该研究获得了国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目资助 。

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青少年早发性痛风新危害基因鉴定及功效研究

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