北京基因组所（国家生物信息中心）相助宣布开放生物医学影像存档库OBIA
生物医学影像在科学研究和临床应用中均发挥着重要作用，生物医学影像数据中包括大宗的隐私信息，如何构建生物医学影像数据治理平台，既包管数据隐私信息的宁静，又能增进全球数据的共享，是目今生物医学影像数据使用中保存的问题。国际上，欧美等国在生物医学影像数据归档治理与共享应用方面走在世界前列，建成多项具有代表性的共享系统，向全球提供公共效劳。然而，我国在该领域尚处在起步阶段，并缺乏公共的医学影像数据效劳平台。
近日，pg电子官网（国家生物信息中心）与中国人民解放军总医院第七医学中心相助开发的“开放生物医学影像存档库（OBIA）”正式上线运行，向海内外科研人员提供医学影像数据递交、归档、宣布与共享的公共效劳。研究结果以“OBIA: An Open Biomedical Imaging Archive”为题在国际学术期刊Genomics Proteomics & Bioinformatics 在线宣布。
OBIA是一个集中存储、去识别的生物医学影像归档库。OBIA使用五个数据工具（Collection、Individual、Study、Series和Image）组织图像数据，与BioProject和GSA-Human无缝集成，有助于整合图像和基因组数据，以支持多组学剖析。为包管影像数据中隐私信息的宁静，OBIA制定了统一的去识别和质量控制流程，并设置了开放会见和受控会见两种差别类型的数据会见战略。别的，OBIA提供了友好直观的网络界面，用户可以很便当的实现对数据的提交，浏览，检索，申请和下载。
截止到2023年9月，OBIA收录的影像数据包括子宫内膜癌、卵巢癌和宫颈癌三大妇科肿瘤，来自4,136项研究的937个个体，包括24,701个系列和1,938,309幅影像，涵盖了9种模态和30个解剖部位。代表性的影像模态包括盘算机断层扫描（CT）、磁共振（MR）和数字射线摄影（DX） ；解剖部位包括腹部、乳房、胸部、头部、肝脏和盆腔等。别的，还收集了相关的临床元数据，如人口统计数据、病史、家族史、诊断、病理类型和治疗要领等。OBIA作为一个生物医学影像数据治理平台，向全球提供开放会见以增进科学研究的生长。
pg电子官网（国家生物信息中心）博士生金恩慧、中国人民解放军医学院博士生赵东莉、pg电子官网（国家生物信息中心）硕士生吴港澳为该文配合第一作者，pg电子官网（国家生物信息中心）孙艳玲博士、中国人民解放军总医院妇产医院部张哲博士、pg电子官网（国家生物信息中心）赵文明正高级工程师、中国人民解放军总医院妇产医院部孟元光教授为该文配合通讯作者。该研究获得了pg电子官网战略先导专项、pg电子官网基因组数据中心运维计划和pg电子官网要害技术人才计划等项目支持。
OBIA数据模型
OBIA去识别和质量控制流程
论文链接
