pg电子官网

科技处4月9日(星期三)讲座通知

  学术报告 

  报告题目:利用高频reads剖析线状基因组的末端 

            Characterization of termini of linear genome with high frequency reads 

  报告人: 童贻刚 研究员 

           军事医学科学院微生物流行病研究所 

  主持人: 陈 非 

  

  时  间:201449日(星期三)上午10:00-11:30 

  地  点:pg电子官网1层报告厅 

  报告摘要 大部分病毒(尤其是噬菌体)都具有线状基因组 ,了解这些基因组的末端序列特点关于剖析这些病毒的复制机制、包装机制以及病毒的生命周期具有重要意义。由于这些病毒基因组往往具有末端冗余(正向重复) ,导致在序列拼接时总是形成一个环状的基因组序列 ,无法判断基因组的起始和终止位点的真正位置 ,因此必须用庞大的试验来确定基因组的起始和终止位置。本研究利用高通量测序数据 ,在完成病毒基因组全序列拼接的同时 ,通太过析测序数据中的高频reads ,直接确定基因组的上下游末端序列 ,获得了数十株病毒的末端序列。同时为了证明此要领的可靠性 ,我们在病毒基因组末端人工连接接头 ,然后进行序列测定 ,所获得的结果与我们预期的结果完全一致。结论:本研究利用高通量测序数据 ,在拼接全基因组的同时直接确定病毒基因组的末端序列 ,为病毒基因组剖析提供了特另外信息。 

    

  ------------------ 

  接待加入! 

 
附件下载:
网站地图