美国印第安纳普渡大学刘晓文博士会见基因组所
11月14日,美国印第安纳普渡大学刘晓文博士,应Genomics, Proteomics & Bioinformatics (GPB)编辑部焦玉霞博士的邀请,到基因组所进行学术会见交流,与基因组所刘斯奇、吴琳、娄晓敏及王全会博士等进行了长时间的交流与探讨,并在基因组所为相关科研人员做了题为“Computational Challenges in Top-Down Proteomics”的学术报告,娄晓敏博士主持了本次报告会。
刘晓文博士的研究团队在古板Bottom-up卵白质组学研究的基础上,致力于开发新兴的Top-down卵白组学的盘算要领。通过动态计划等算法,刘博士研究组开发了一系列开放获取的专业软件,以克服Top-town卵白组学剖析中假阳性率高、速度慢、对盘算要求高等困难。别的,刘博士实验将Bottom-up和Top-down卵白组学要领结合起来,对突变高修饰庞大的卵白,如抗体卵白进行de novo卵白测序,取得了较高的准确率。这些结果关于研究翻译后修饰(PTMs)等有很是重要的意义。本次讲座以互动方法进行,以解答观众席中源源不绝的问题。刘博士还慷慨地提供了正在开发软件的试用时机。
刘晓文博士2007年获香港都会大学盘算机科学专业博士学位,后于香港都会大学从事助理研究员事情,并于2008年开始先后在加拿大西安大概大学、加拿大滑铁卢大学及美国加尼福利亚大学进行博士后研究事情。2012年至今,担当美国印第安纳波利斯大学BioHealth信息学系的助理教授,主要进行生物信息学和盘算生物学研究。
近年来,刘博士在PNAS, Molecular & Cellular Proteomics, Journal of Proteome Research, BMC Genomics, Proteomics, Bioinformatics等本事域知名期刊宣布论文20余篇。他从2013年起担当GPB期刊编委,积极资助期刊组稿、审稿、宣传,为期刊生长做出了孝敬。
为更好地搭建海内科研人员与本事域国际专家学术交流的平台,北京基因组研究所GPB编辑部组织开展了GPB杰出学者论坛运动。主要是借助编辑部外出加入学术集会的时机,寻找合适的杰出专家学者,来本所进行学术会见,与相关研究员进行交流、探讨与相助,并为科研人员做学术报告,充分发挥编辑部的桥梁纽带作用,增进对最新研究动态的交流。

刘晓文博士在基因组所作学术报告






