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基因组所担负的pg电子官网重点安排特支项目“南海部分海区重要微生物类群基因组多样性开端研究”完成结题验收

  2016815日,pg电子官网前沿科学与教育局在北京组织召开了pg电子官网重点安排特支项目“南海部分海区重要微生物类群基因组多样性开端研究”结题验收会。验收专家组由来自中科院植物所、微生物所、遗传发育所、首都师范大学、山东大学的7位业务专家,以及来自中国生物技术生长中心的财务专家组成。中科院植物所洪德元院士任专家组组长�<嵊芍锌圃呵把鼐稚蒲Тι蛞愦Τぶ鞒�,基因组所党委副书记王丽萍加入了集会。 

  该项目由中科院北京基因组研究所和中科院南海海洋所配合担负,张德兴研究员主持。经过3年的研究,项目对从南海差别海域收罗和疏散的10株放线菌、9株链霉菌进行了全基因组测序、拼接和注释,并通过泛基因组学和功效基因组学剖析以及比较进化基因组学剖析,发明放线菌专属的一些天然产品(如聚酮类、多肽类、醌类等)的代谢途径,探讨了海洋链霉菌类群对海洋高盐、低温、寡营养生境的适应机制;完成34个海洋站位143个样品的16S rDNA测序,以及45个样品的宏基因组测序和剖析,剖析了南海海洋细菌群落组成与深度、温度、盐度、磷酸盐和硅酸盐等情况因素的关联性,探讨了微生物群落和功效特征的动态历程及其变革机制;开发了基于新一代测序技术的微生物基因组的高效优化拼接要领的GAP PRIE软件,以及用于对海量微生物基因组数据进行泛基因组特征剖析的PanGP软件,并实现了数据和结果的可视化展示;建设包括南海微生物的海洋微生物组学数据库及网站,实现了数据共享与海洋微生物资源的科学普及。项目的完成为今后开发利用海洋微生物资源涤讪了基础,同时也增强了对我国南海海区的深入科学研究。 

  专家组认真审阅结题报告,听取了项目及课题组的汇报并进行了提问和深入讨论。经评定,专家组一致认为该项目很好的完成了既定目标,同意该项目通过验收。专家组体现,中科院在2013年初就安排了该项目,具有久远战略眼光,应继续在已经取得的优势的基础上,进一步增强顶层设计,组织协调步队,充分发挥中科院的优势,在海洋微生物资源领域研究方面发挥更大的作用。

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