北京基因组所开发完成植物RNA编辑体数据库PED
近日，pg电子官网生命与健康大数据中心开发了国际上首个植物RNA编辑体数据库—PED（Plant Editosome Database） 。该库基于人工审编整合多种植物RNA编辑因子和大宗RNA编辑事件等信息 。研究结果以“Plant editosome database: a curated database of RNA editosome in plants”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research在线宣布 。
RNA编辑在植物的生长、开花、细胞器发育、应激反应等历程中发挥重要作用 。近些年来，大宗RNA编辑因子被鉴定出来加入RNA编辑历程，它们会组合成庞大多样的编辑复合体（RNA editosome）并对特异的RNA位点行使编辑功效 。虽然已保存几个整合RNA编辑位点信息的数据库，但目前仍缺少系统梳理整合植物RNA编辑因子的专门数据库 �；谖南咨蟊嗪椭参锵赴骰蜃樽⑹�，PED全面整合了RNA编辑因子及相关数据，为研究人员提供关于植物RNA编辑的最新相关信息 。
目前，PED收录了在8种模式植物（拟南芥、水稻、玉米等）中发明的98个RNA编辑因子，描述信息包括RNA编辑因子注释，编辑因子与编辑位点相互作用，编辑因子对植物功效和表型影响以及详细实验证据等 。别的，PED还整理了来自1,621种植物的20,836个RNA编辑事件，这些位点漫衍在203种细胞器基因上，涵盖1673个植物细胞器 。
PED数据库整合及标准化RNA编辑因子，RNA编辑事件及其相互作用等信息，为RNA编辑机制及RNA编辑系统进化研究涤讪数据基础 。别的，PED配备了界面友好的浏览、盘问、筛选和下载功效，用户可以便当地从RNA编辑因子、RNA编辑事件、物种三个角度浏览并下载相关注释信息 。
该研究获得了pg电子官网战略性先导科技专项、pg电子官网国际相助计划、国家科技攻关计划等项目基金的资助 。
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