北京基因组所与北京协和医院相助揭示胰腺癌肿瘤-微情况高度异质性细胞特征
胰腺导管腺癌（PDAC）被称为“癌中之王”，早期诊断困难、治疗效果欠佳、病死率居高不下，五年生存率仅为8.5%，具有很强的肿瘤异质性。为解决生命与健康领域重大医学科学前沿问题，2018年，中科院—北京协和医院健康科学研究中心建立。由赵玉沛院士、周琪院士担当科学照料，中科院北京基因组研究所杨运桂团队、韩大力团队与北京协和医院吴文铭团队在健康科学研究中心支持下，为探究PDAC爆发生长的分子机制以及肿瘤微情况的调控作用，通过相助研究，利用单细胞转录组测序技术，系统鉴定并剖析了PDAC病人和比照胰腺样本细胞类型，剖析了胰腺癌肿瘤-微情况高度异质性特征，揭示了肿瘤亚群细胞与浸润免疫细胞间相互关系，提出了新的潜在治疗靶点。
研究团队通过对24例术前未经放化疗的人胰腺癌组织的41986个细胞及11例比照胰腺组织的15544个细胞进行单细胞转录组剖析，绘制了大样自己胰腺导管腺癌细胞图谱。首先，通过t-SNE 剖析鉴定出胰腺癌组织中10类细胞：I型导管细胞、II 型导管细胞、腺泡细胞、内排泄细胞、内皮细胞、成纤维细胞、星型细胞、巨噬细胞、T细胞和B细胞。通过CNV结合差别剖析和功效富集，鉴定II型导管细胞是胰腺癌组织的恶性细胞。其次，利用轨迹剖析研究了PDAC从癌前状态到恶性状态的基因表达模式，发明在PDAC进展历程中，包括ErbB和Notch信号通路在内的多个经典致癌通路被激活。特别是在肿瘤进展的晚期，细胞增殖和迁移的相关基因被显著激活。另外，团队在II型导管细胞中鉴定出具备高增殖、高转移潜能等在内的七个细胞亚群。其中，亚群7（增殖性导管亚群）的特征基因富集在细胞周期和细胞增殖相关通路。进一步，结合TCGA数据库的PAAD数据集进行整合剖析发明，肿瘤组织中增殖性导管细胞亚群特征基因的表达水平与肿瘤浸润T细胞的激活保存显著的负相关性，病理切片染色也证明了这两群细胞数量的关联性，提示增殖性导管细胞的保存和活化T细胞的缺失可能配合导致PDAC患者的不良预后。
相关研究结果在7月4日以Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression in pancreatic ductal adenocarcinoma为题在Cell Research杂志在线宣布。
该研究为探索胰腺导管腺癌的致病机制、揭示肿瘤微情况的作用提供了重要的组学资源，揭示了增殖性导管亚群抑制 T 细胞浸润和活化的新机制，提出了CDK1，PLK1和AURKA等增殖性导管亚群标记物作为精准治疗靶点的可行性，为胰腺癌精准诊治提供了新的研究偏向。该研究获得了pg电子官网战略性先导科技专项、国家重点研发计划、中国医学科学院医学与健康科技立异工程、国家自然科学基金等基金资助。
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胰腺癌肿瘤-微情况高度异质性细胞特征
