基因组所重复序列与哺乳动物基因组内含子扩张关系研究获进展
近日，在pg电子官网副所长、基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员，和雷红星研究员的指导下，基因组所王大鹏博士、博士研究生苏尧等科研人员，在哺乳动物基因组内含子扩张与基因功效关系研究，及突变和自然选择在基因组进化中的作用研究取得新进展，相关学术论文在《Evolutionary Bioinformatics》杂志宣布。
基因组重复序列（Repetitive Sequence，RS）是庞大且进化活跃的，其对基因和基因组结构的稳定和动态性有着很大影响，并且与生物学功效密切相关。处于差别基因结构区域如外显子、内含子和基因间区的重复序列受到差别水平选择压力的影响。一般来说，这些序列重复的DNA片段通常被分为两类：即卫星序列（Satellite Sequences，SSs）和转座元件（transposable elements，TEs）。目前，许多脊椎动物的基因组测序事情已经完成，这为研究差别脊椎动物物种中TE和SS引导的内含子扩张提供了条件。
为了研究内含子序列中TE和SS的进化特征，科研人员选取12种哺乳动物基因组按进化分支分成4组：灵长类、大型哺乳类、啮齿类和原始哺乳类，并用4种非哺乳类脊椎动物作为外群。研究标明：受TE或SS支配的内含子扩张机制在内含子长度、位置和基因功效等方面具有特定的分支特异性。研究发明，TE增加内含子长度的趋势比SS要强，TE和SS对哺乳动物的综合影响要大于任何两者之一的单独影响之简单加和，而在非哺乳脊椎动物中的情况则相反。
在自然选择的作用下，TE和SS衍生的重复序列体现出的作用在差别水平和作用机制上影响了脊椎动物基因和基因组的巨细及组分，也是造成物种剖析（脊椎动物种种条理的类别）和物种多样性的重要因素。该研究结果将资助科研人员加深关于基因组非编码区域的功效调控和进化纪律的理解和认识。
文章链接：
http://www.la-press.com/transposon-derived-and-satellite-derived-repetitive-sequences-play-dis-article-a3227
4种内含子的位置比照
